Gålöstiftelsens styrelse har det yttersta ansvaret för stiftelsens förvaltning och består av tre självskrivna ledamöter samt sju ordinarie ledamöter och tre hedersledamöter. Den dagliga verksamheten leds av Generalsekreteraren och kanslipersonalen samt arbetsutskottets fem ledamöter som utför operativt arbete, exempelvis ansökningsurval.